扬州育种攻关有了新突破!日前,记者从市农业农村局获悉,扬州大学动物科学与技术学院包文斌教授团队成功研发“苏芯一号”猪抗病育种芯片,并正式在生产育种中推广应用。这款芯片涵盖了与仔猪腹泻、流感等多种疾病抗性,以及一般抗病力、繁殖性能等性状相关的SNPs和Indels,为我国生猪遗传改良,尤其是抗病性状的改良提供了高效工具。
据悉,“苏芯一号”猪抗病育种芯片包含243个功能位点。团队克服了当前猪抗性表型不易度量及抗性群体缺乏,难以通过全基因组关联分析策略有效筛选抗性相关SNPs位点等瓶颈,通过大规模平行报告分析、先导编辑及基因功能验证等技术手段,鉴定出一批影响猪抗病和繁殖性能的遗传变异位点。
芯片设计依托我国地方猪品种和商业猪品种基因组测序数据,经严格筛选获得覆盖全基因组的高质量变异位点,并采用北京康普森农业科技有限公司研发的CAGT靶向捕获测序技术进行靶位点捕获。该芯片聚焦猪重要疾病抗性育种,是对现有商业化育种芯片的有效补充,可弥补商业化芯片在疾病抗性位点覆盖上的不足,使生猪育种实现优质高产和抗病的多性状平衡选育。
“苏芯一号”猪抗病育种芯片具有高效、精准与低成本的优势,可在个体早期快速识别疾病抗性优良基因,缩短育种周期、提高选育准确性,将在提升种猪健康养殖水平、推动生猪产业高质量发展等方面发挥重要作用。